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Fragment Analyzer (AATI ,Advanced Analytical Technologies)全自動(dòng)毛細(xì)管電泳儀(安捷倫 Agilent 5200,5300,5400),使用DNF-464-0500試劑盒做三代測(cè)文庫樣品的質(zhì)控。Pacbio公司指定 DNF-464-0500試劑盒為專用的質(zhì)控試劑盒。分析軟件Prosize 3.0會(huì)給出一個(gè)GQN值,用0-10表示gDNA的質(zhì)量分?jǐn)?shù)。數(shù)值越大說明gDNA樣品完整性越好。此試劑盒不光可以做三代文庫的質(zhì)控,也可以檢測(cè)大片段smear的差異。
注:此圖為DNF-464-0500試劑盒所使用的ladder
注:此圖為使用DNF-464-0500檢測(cè)10K 左右樣品的結(jié)果。
PROsize3.0軟件可以精確給出樣品的片段大小及濃度。